莲花香灸作为传统艾灸香灸的进化体，它的作用机制，尚没有一种学说能完全阐释，当前的相关研究主要倾向于以下几种观点：
1、认为莲花香灸过程中，局部的温热刺激的zhi疗疾bing的关键因素：这种温热刺激，可以改善局部血液循环和淋巴循环，加速细胞新陈代谢，促进灸症，血肿等病理产物的吸收，修复损伤组织，使肌肉、神经的功能与机构恢复正常，使机体内环境恢复相对平衡或建立一个新的平衡，从而达到调理及zhi疗疾bing的目的。
2、认为机体在莲花香灸灸温热作用下，激活了体内一些特殊物质：如有报道称，香灸可以提高放，化疗患者白细胞的数量，使香灸产生的白细胞成熟高。对机体进行香灸，可以增加白细胞、从而激活和加强了机体没有系统的功能，发挥其抵御外邪、杀伤细菌病毒、捍卫健康的作用。
3、认为莲花香灸通过经络调节发挥作用：莲花香灸的温热刺激作用于经络腧穴，是对经气的一种激发，通过腧穴的双向良性调节作用，从而发挥其调节气血、平衡阴阳的功xiao。